将房间进行三合一是提升空间利用率和生产效率的核心技巧。能够进行三合并的房间种类覆盖了大部分基础生产及功能设施。电力生产端的发电厂与后期的核电站、负责食物供应的餐厅与花园、保障水源的净水厂以及同时产出食物和水的核子可乐装瓶室，都支持三个房间合并为一个大型房间。居住用途的宿舍、治疗用的医疗站、研发用的科学实验室、提升幸福度的广播室，以及制造装备的武器工坊和装备工坊，同样适用三合一的规则。这些房间合并后，其容量和单位时间的产出能力都会得到显著增强。
实现三个房间的成功合并，必须同时满足几个不可妥协的条件。待合并的房间必须是完全相同的类型，餐厅只能和餐厅合并，电站只能和电站合并，不同功能的房间无法凑在一起。三个房间的等级必须完全一致，无论是1级、2级还是3级，必须全部相同，如果有一个房间等级较低，你需要先消耗瓶盖将其升级到与其他房间同级。也是至关重要的一点，三个房间必须在物理布局上紧挨着，排成笔直的一列，中间不能插入电梯、其他类型的房间或是未被清理的岩石障碍。系统会自动检测符合上述条件的房间并将其合并，你无法手动将第四个房间加入已合并的区域。
成功进行三合并后，所带来的收益是多方且实在的。最直接的提升在于资源产出效率，三联大房间的生产速度相当于三个单间之和，但你只需点击一次即可收取全部资源，大大简化了操作。在空间规划上，合并有效节约了地盘，为建造其他设施腾出了宝贵的位置。在人员配置方面，一个三联大房间可以容纳最多六名居民同时工作，相比分散的三个小房间，更能集中高属性居民的优势，从而最大化生产效率。当遭遇火灾、虫害等内部危机或外来入侵时，大型房间内聚集的更多居民能够更快地协同处理事件，提升避难所的防御稳定性。
如果你在前期规划时布局有误，或者后期希望调整房间位置，游戏也提供了补救措施。你可以通过点击底层的主控制室，使用其中的重构功能。进入重构模式后，你可以选中已经合并的大型房间，将其拆散回独立的单个房间，然后就可以自由拖动这些房间，将它们重新安置在符合条件的位置上，等待它们再次自动合并。这让你有机会优化避难所的布局，但拆除和重建会消耗额外的瓶盖，因此在初期进行长远规划仍然是更经济的选择。
